More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3169 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
462 aa  906    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  49.68 
 
 
467 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  43.83 
 
 
465 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  46.44 
 
 
492 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  43.61 
 
 
465 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.15 
 
 
474 aa  366  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  44.64 
 
 
472 aa  360  4e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  43.34 
 
 
456 aa  359  5e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  43.42 
 
 
465 aa  352  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  44.32 
 
 
466 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  43.93 
 
 
487 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  41.53 
 
 
456 aa  339  8e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  41.76 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 
462 aa  326  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 
474 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  42.09 
 
 
475 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  40.04 
 
 
461 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  37.39 
 
 
479 aa  292  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  34.06 
 
 
463 aa  272  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
453 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  39.65 
 
 
458 aa  266  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  34.63 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  36.47 
 
 
469 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
466 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 
446 aa  256  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 
497 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  34.31 
 
 
453 aa  243  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  32.33 
 
 
467 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 
475 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.97 
 
 
522 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.84 
 
 
474 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 
475 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 
477 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.37 
 
 
478 aa  189  8e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32 
 
 
486 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
459 aa  186  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
496 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.11 
 
 
501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 
471 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
478 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 
465 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
461 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
460 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 
483 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 
478 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 
493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 
482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 
482 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  29.23 
 
 
488 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 
483 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 
477 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 
495 aa  166  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 
482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 
482 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.74 
 
 
540 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 
493 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.64 
 
 
472 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
505 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 
487 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 
478 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 
484 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 
485 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.46 
 
 
500 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  30.73 
 
 
461 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
493 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 
478 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 
502 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 
478 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  28.9 
 
 
470 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
476 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.11 
 
 
534 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  31.99 
 
 
498 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 
539 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.26 
 
 
488 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 
480 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
464 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0999  major facilitator transporter  33.33 
 
 
430 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.77003  normal  0.0952773 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  28.54 
 
 
458 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  30.02 
 
 
477 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  31.74 
 
 
484 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  29.02 
 
 
464 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  30.07 
 
 
462 aa  149  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.63 
 
 
469 aa  149  8e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 
521 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  31.88 
 
 
560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  31.36 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  29.41 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  28.53 
 
 
480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  28.26 
 
 
470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  31.73 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.61 
 
 
455 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  28.82 
 
 
457 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  29.61 
 
 
446 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  28.82 
 
 
457 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  28.57 
 
 
457 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
457 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>