More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2098 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 466 aa  904    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  45.18 
 
 		 467 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  40.67 
 
 		 492 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  40 
 
 		 465 aa  318  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 465 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.07 
 
 		 474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 472 aa  306  6e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  39.17 
 
 		 465 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 487 aa  285  8e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  40.27 
 
 		 469 aa  286  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  36.4 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 456 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 474 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 462 aa  234  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  33.11 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 467 aa  205  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.49 
 
 		 522 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.19 
 
 		 475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.69 
 
 		 471 aa  179  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 		 475 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.41 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.92 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.46 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 456 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.03 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.94 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.73 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.01 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 469 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  30.69 
 
 		 508 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.07 
 
 		 493 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 476 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.62 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 466 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.39 
 
 		 493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.38 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 503 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.63 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 		 489 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 		 528 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.22 
 
 		 469 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 646 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.75 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.15 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 646 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  31.03 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 		 646 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.17 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 		 509 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.28 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  31.2 
 
 		 473 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 		 489 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.72 
 
 		 483 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 		 540 aa  146  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 460 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  32.82 
 
 		 444 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 416 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 570 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.08 
 
 		 529 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 505 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 589 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.28 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 491 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>