More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1762 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  100 
 
 
477 aa  935    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.13 
 
 
478 aa  392  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.06 
 
 
471 aa  389  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.11 
 
 
469 aa  378  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  43.1 
 
 
478 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  41.76 
 
 
470 aa  359  6e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.81 
 
 
493 aa  342  8e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 
486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.58 
 
 
482 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  31.66 
 
 
492 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
573 aa  203  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  32.24 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  34.03 
 
 
641 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  30.97 
 
 
472 aa  192  9e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  31.69 
 
 
589 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.54 
 
 
477 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  32.11 
 
 
487 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 
512 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
570 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.24 
 
 
474 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
581 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  29.62 
 
 
486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 
505 aa  183  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.71 
 
 
477 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 
509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.25 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  32.77 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 
540 aa  179  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.83 
 
 
493 aa  179  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  30.08 
 
 
467 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 
465 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 
500 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  30.38 
 
 
592 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  31.47 
 
 
465 aa  176  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  31.47 
 
 
465 aa  176  8e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  29.81 
 
 
582 aa  176  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 
478 aa  176  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
608 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 
477 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.92 
 
 
482 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.42 
 
 
482 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.2 
 
 
461 aa  170  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.98 
 
 
474 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  29.44 
 
 
596 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 
475 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  27 
 
 
508 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  28.67 
 
 
576 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
497 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  29.71 
 
 
562 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  28.42 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  30.17 
 
 
466 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.47 
 
 
609 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  31.44 
 
 
589 aa  167  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  30.85 
 
 
462 aa  167  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3504  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
578 aa  167  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.42 
 
 
627 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 
534 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
476 aa  166  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 
504 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.24 
 
 
493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  30.18 
 
 
560 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.13 
 
 
475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 
505 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.24 
 
 
467 aa  163  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1554  major facilitator transporter  28.87 
 
 
610 aa  163  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30485  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
582 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  31.48 
 
 
467 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  27.68 
 
 
467 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 
579 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  30.5 
 
 
475 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 
522 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
591 aa  160  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 
534 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
462 aa  159  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 
453 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.58 
 
 
494 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.19 
 
 
510 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 
504 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  28.21 
 
 
456 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
504 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.87 
 
 
528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
539 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  28.21 
 
 
456 aa  157  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 
534 aa  156  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 
489 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  27.31 
 
 
453 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
478 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0555  major facilitator transporter  27.88 
 
 
587 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
478 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
466 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0565  major facilitator transporter  27.88 
 
 
587 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0577  major facilitator superfamily transporter  27.88 
 
 
587 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.410817  decreased coverage  0.00469629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  29.66 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 
506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  33.59 
 
 
478 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  30.72 
 
 
582 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 
472 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  33.33 
 
 
478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>