More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1772 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  94.08 
 
 
456 aa  824    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  100 
 
 
456 aa  891    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  95.18 
 
 
456 aa  842    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  50.77 
 
 
467 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  49.33 
 
 
472 aa  415  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  50.22 
 
 
492 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.78 
 
 
474 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  48.99 
 
 
466 aa  403  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  48.68 
 
 
487 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  47.59 
 
 
465 aa  398  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  47.59 
 
 
465 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  48.36 
 
 
465 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  48.79 
 
 
462 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  41.23 
 
 
461 aa  352  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  41.36 
 
 
475 aa  335  9e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 
462 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  42.3 
 
 
458 aa  322  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 
453 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  37.72 
 
 
467 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  39.91 
 
 
453 aa  312  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 
474 aa  310  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  37.82 
 
 
479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  37.05 
 
 
469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 
497 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 
446 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  34 
 
 
463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
466 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  35.97 
 
 
467 aa  265  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.72 
 
 
475 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 
474 aa  256  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 
465 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 
482 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.76 
 
 
477 aa  209  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
459 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.88 
 
 
477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.36 
 
 
461 aa  199  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 
471 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 
482 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 
483 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.6 
 
 
522 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.99 
 
 
482 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 
478 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 
482 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 
475 aa  187  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.46 
 
 
486 aa  186  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 
496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 
483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.97 
 
 
478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 
456 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.91 
 
 
493 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.46 
 
 
487 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  34.22 
 
 
526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  32.65 
 
 
462 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.36 
 
 
534 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.69 
 
 
500 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 
478 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  29.59 
 
 
473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  29.72 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  28.28 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  28.28 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  28.28 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  29.72 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
457 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  29.72 
 
 
457 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  29.72 
 
 
457 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  29.72 
 
 
457 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  29.72 
 
 
457 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  30.51 
 
 
470 aa  173  6.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 
493 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  29.72 
 
 
457 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.92 
 
 
503 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 
490 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  29.02 
 
 
480 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  29.47 
 
 
457 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  27.07 
 
 
446 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 
477 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  28.83 
 
 
516 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0856329 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  29.9 
 
 
476 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  26.87 
 
 
488 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  28.5 
 
 
491 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.67 
 
 
474 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  27.92 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.78 
 
 
538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 
522 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  28.24 
 
 
498 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.08 
 
 
462 aa  164  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  27.85 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 
502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  30.02 
 
 
478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  27.98 
 
 
497 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  27.85 
 
 
442 aa  163  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.41 
 
 
455 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 
525 aa  163  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 
455 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
520 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.04 
 
 
459 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  26.99 
 
 
457 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>