More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2132 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  100 
 
 		 463 aa  931    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  67.56 
 
 		 479 aa  625  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  36.21 
 
 		 492 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.33 
 
 		 474 aa  292  7e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  37 
 
 		 466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  34 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 467 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 461 aa  276  6e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  32.26 
 
 		 465 aa  276  7e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 487 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  32.33 
 
 		 465 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  33.47 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  31.83 
 
 		 453 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 497 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 		 453 aa  237  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 458 aa  229  8e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  30.79 
 
 		 467 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 500 aa  223  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 		 483 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  29.31 
 
 		 469 aa  206  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 459 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 		 475 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 522 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.39 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.23 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 460 aa  176  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 461 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.47 
 
 		 478 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 		 487 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 482 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.85 
 
 		 456 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.04 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.94 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.72 
 
 		 478 aa  169  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 		 478 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 505 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.61 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.62 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.58 
 
 		 496 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  27.77 
 
 		 470 aa  160  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.1 
 
 		 472 aa  159  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  28.95 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 455 aa  156  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 455 aa  156  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 455 aa  156  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  28.81 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  28.57 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  28.81 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.47 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  28.57 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 476 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.58 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  27.18 
 
 		 526 aa  153  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.37 
 
 		 529 aa  150  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.02 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  26.4 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.09 
 
 		 539 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>