More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1035 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  100 
 
 		 456 aa  889    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  92.98 
 
 		 456 aa  818    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  95.18 
 
 		 456 aa  821    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  50.33 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  48.89 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  49.55 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.33 
 
 		 474 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  48.03 
 
 		 487 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  48.77 
 
 		 466 aa  398  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  47.37 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  47.92 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  40.13 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 475 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 		 462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  37.94 
 
 		 467 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  39.68 
 
 		 453 aa  308  9e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  36.38 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 497 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 463 aa  286  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 		 466 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.22 
 
 		 475 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 474 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.12 
 
 		 477 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 459 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.03 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.76 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  30.28 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.82 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 482 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 		 482 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29 
 
 		 471 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.61 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  32.06 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.97 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 		 486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.43 
 
 		 478 aa  180  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.62 
 
 		 456 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.89 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.24 
 
 		 478 aa  173  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  29.59 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.39 
 
 		 500 aa  171  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 516 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0856329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  28.72 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  28.72 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 457 aa  167  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 457 aa  167  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 457 aa  167  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  28.72 
 
 		 457 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 457 aa  167  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  28.72 
 
 		 457 aa  166  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  29.27 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.72 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 480 aa  163  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 476 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 		 538 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.9 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 498 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 477 aa  159  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 488 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 		 458 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  27.85 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  27.85 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>