More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0387 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  100 
 
 
467 aa  892    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  36.83 
 
 
456 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  35.18 
 
 
456 aa  259  9e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  35.78 
 
 
465 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  35.56 
 
 
465 aa  256  6e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  36.27 
 
 
467 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  35.55 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  35.36 
 
 
492 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 
474 aa  249  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  35.78 
 
 
465 aa  249  9e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  35.23 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  32.84 
 
 
487 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  34.83 
 
 
461 aa  236  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 
486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.48 
 
 
482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  34.22 
 
 
466 aa  230  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  32.1 
 
 
467 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.54 
 
 
474 aa  226  7e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  33.12 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  33.69 
 
 
458 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.19 
 
 
475 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  32.75 
 
 
469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.16 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  30.65 
 
 
453 aa  213  9e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
466 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
446 aa  204  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 
462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
497 aa  196  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  33.91 
 
 
477 aa  193  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
453 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  31.34 
 
 
479 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.94 
 
 
471 aa  189  9e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 
482 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 
482 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  29.59 
 
 
470 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
474 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  30.08 
 
 
477 aa  179  9e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 
522 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.81 
 
 
493 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  30.15 
 
 
463 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.83 
 
 
478 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  31.7 
 
 
596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  33.93 
 
 
589 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.61 
 
 
482 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.35 
 
 
475 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.85 
 
 
487 aa  170  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 
484 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 
478 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 
483 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  31.1 
 
 
486 aa  169  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  31.7 
 
 
478 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  34.96 
 
 
562 aa  166  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 
570 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 
477 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 
477 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  28.65 
 
 
582 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  32.1 
 
 
576 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 
478 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.18 
 
 
462 aa  159  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.8 
 
 
500 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  31.74 
 
 
641 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.7 
 
 
477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
573 aa  156  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 
522 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 
478 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  28.16 
 
 
463 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 
504 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
460 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.27 
 
 
515 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  28.13 
 
 
582 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.39 
 
 
452 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  27.75 
 
 
582 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
582 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.22 
 
 
478 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.45 
 
 
483 aa  150  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  29.1 
 
 
592 aa  149  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  28.17 
 
 
470 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  31.16 
 
 
560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  27.19 
 
 
582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.67 
 
 
537 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.03 
 
 
515 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 
522 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 
458 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.59 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1354  putative export protein  29.44 
 
 
498 aa  146  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338095  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.91 
 
 
585 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  27.19 
 
 
582 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
608 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
476 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  27.58 
 
 
473 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.76 
 
 
487 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 
488 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3504  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
578 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.1 
 
 
478 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  31.1 
 
 
510 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.85 
 
 
469 aa  144  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 
493 aa  144  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>