More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1651 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  67.81 
 
 		 570 aa  758    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  59.22 
 
 		 582 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  60 
 
 		 581 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  100 
 
 		 641 aa  1238    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  58.3 
 
 		 576 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  54.94 
 
 		 608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3504  major facilitator superfamily MFS_1  57.6 
 
 		 578 aa  596  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0565  major facilitator transporter  58.2 
 
 		 587 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0577  major facilitator superfamily transporter  58.2 
 
 		 587 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.410817  decreased coverage  0.00469629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0555  major facilitator transporter  58.2 
 
 		 587 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  54.34 
 
 		 582 aa  569  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  53.23 
 
 		 573 aa  561  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  52.86 
 
 		 591 aa  551  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1554  major facilitator transporter  53.68 
 
 		 610 aa  547  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  47.78 
 
 		 589 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  49.46 
 
 		 596 aa  510  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  46.47 
 
 		 592 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  49.19 
 
 		 562 aa  486  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 560 aa  461  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0518  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 		 567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1253  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 562 aa  448  1.0000000000000001e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 589 aa  333  4e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.18 
 
 		 482 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.95 
 
 		 486 aa  278  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.73 
 
 		 487 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 477 aa  236  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 465 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 		 493 aa  206  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 474 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 486 aa  194  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 478 aa  191  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.71 
 
 		 461 aa  189  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 470 aa  189  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 522 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.91 
 
 		 475 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.92 
 
 		 471 aa  182  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.27 
 
 		 493 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.7 
 
 		 488 aa  174  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 		 478 aa  173  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.29 
 
 		 505 aa  171  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.69 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 		 456 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.56 
 
 		 496 aa  167  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 		 504 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.62 
 
 		 477 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 		 474 aa  166  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  32.75 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.99 
 
 		 522 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 524 aa  165  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.19 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 501 aa  163  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  31.98 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 495 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  31.98 
 
 		 508 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 		 522 aa  160  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.84 
 
 		 462 aa  160  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.21 
 
 		 500 aa  158  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 460 aa  158  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.6 
 
 		 534 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 467 aa  158  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 		 489 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 		 534 aa  154  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.76 
 
 		 478 aa  154  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 		 525 aa  153  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 493 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.08 
 
 		 469 aa  152  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.02 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.34 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 482 aa  151  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 462 aa  151  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.06 
 
 		 510 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 512 aa  150  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 		 509 aa  150  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.37 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 472 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.04 
 
 		 534 aa  148  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.23 
 
 		 641 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 482 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 463 aa  147  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 		 502 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 		 478 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.63 
 
 		 520 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 457 aa  146  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.94 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 		 540 aa  145  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  31.51 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.69 
 
 		 522 aa  144  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  29.02 
 
 		 484 aa  144  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>