More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0726 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0565  major facilitator transporter  80.04 
 
 
587 aa  884    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  61.99 
 
 
582 aa  709    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0577  major facilitator superfamily transporter  80.04 
 
 
587 aa  884    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.410817  decreased coverage  0.00469629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
576 aa  1125    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  64.93 
 
 
581 aa  731    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0555  major facilitator transporter  80.04 
 
 
587 aa  880    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  57.19 
 
 
608 aa  627  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3504  major facilitator superfamily MFS_1  60.37 
 
 
578 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  59.59 
 
 
641 aa  618  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  56.35 
 
 
570 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  57.65 
 
 
591 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  55.61 
 
 
582 aa  588  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1554  major facilitator transporter  54.69 
 
 
610 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30485  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  52.96 
 
 
573 aa  549  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  50.74 
 
 
562 aa  496  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  44.48 
 
 
589 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  48.54 
 
 
596 aa  491  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  43.69 
 
 
592 aa  478  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1253  major facilitator transporter  46.42 
 
 
562 aa  462  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  43.07 
 
 
560 aa  461  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0518  major facilitator superfamily MFS_1  46.22 
 
 
567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  37.18 
 
 
589 aa  315  9.999999999999999e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 
482 aa  286  8e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.5 
 
 
486 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  38.9 
 
 
477 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 
487 aa  231  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
522 aa  203  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 
478 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.55 
 
 
493 aa  197  6e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  33.56 
 
 
486 aa  195  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 
465 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  32.46 
 
 
478 aa  194  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  34.09 
 
 
470 aa  192  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 
471 aa  187  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 
469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.8 
 
 
495 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 
475 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  31.58 
 
 
465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.51 
 
 
478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.45 
 
 
528 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  31.35 
 
 
465 aa  171  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  32.48 
 
 
487 aa  171  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.73 
 
 
474 aa  170  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 
456 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 
515 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 
514 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  28.67 
 
 
477 aa  169  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 
522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 
488 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.82 
 
 
474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 
477 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.35 
 
 
477 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  29.74 
 
 
472 aa  163  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  29.05 
 
 
508 aa  163  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  32.1 
 
 
467 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5625  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 
482 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.26 
 
 
493 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
462 aa  161  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 
461 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 
532 aa  160  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.41 
 
 
529 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 
502 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.5 
 
 
462 aa  158  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 
494 aa  157  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.49 
 
 
521 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.86 
 
 
534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.03 
 
 
478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 
478 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 
525 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.64 
 
 
500 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.64 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 
583 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.91 
 
 
475 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 
489 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 
478 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  28.77 
 
 
492 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.81 
 
 
496 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 
512 aa  151  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.16 
 
 
522 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 
519 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.51 
 
 
469 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 
478 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 
484 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 
504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
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NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.07 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 
482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  30.31 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
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NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.32 
 
 
530 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
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NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  27.01 
 
 
458 aa  148  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.25 
 
 
493 aa  148  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 
483 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.87 
 
 
522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  31.33 
 
 
463 aa  146  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  29.3 
 
 
470 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
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NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 
509 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.84 
 
 
514 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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