More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1246 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 487 aa  964    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.26 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.59 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  36.53 
 
 		 592 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 470 aa  262  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 560 aa  260  4e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 570 aa  256  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 596 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 573 aa  251  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 589 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 641 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 582 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 582 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 581 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 608 aa  240  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 478 aa  237  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 478 aa  237  4e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  33.4 
 
 		 477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 562 aa  233  4.0000000000000004e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.47 
 
 		 493 aa  233  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 		 471 aa  231  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  34.5 
 
 		 492 aa  231  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  33.18 
 
 		 576 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1253  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 562 aa  229  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 487 aa  227  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  32.88 
 
 		 508 aa  226  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3504  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 578 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0518  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 567 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0565  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0577  major facilitator superfamily transporter  32.72 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.410817  decreased coverage  0.00469629 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 477 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0555  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 587 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 591 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 589 aa  213  7e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1554  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 610 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 		 474 aa  209  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.88 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.64 
 
 		 495 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.26 
 
 		 465 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 		 475 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.98 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 		 493 aa  203  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.55 
 
 		 483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.94 
 
 		 496 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.3 
 
 		 500 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 		 482 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.84 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 501 aa  189  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 465 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  32.28 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 460 aa  183  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 467 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.73 
 
 		 510 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.57 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 		 504 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.54 
 
 		 452 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  32.2 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.63 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.71 
 
 		 492 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5625  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  32.05 
 
 		 467 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  28.47 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 455 aa  176  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.47 
 
 		 492 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 455 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 455 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.01 
 
 		 514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.73 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 		 579 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.22 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 463 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  28.22 
 
 		 492 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.22 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.83 
 
 		 541 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  30.75 
 
 		 458 aa  171  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 467 aa  170  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1566  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 483 aa  170  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.9 
 
 		 478 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 482 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.4 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>