More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0909 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  94.08 
 
 
456 aa  808    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  100 
 
 
456 aa  887    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  92.98 
 
 
456 aa  823    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  51.21 
 
 
467 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  49.56 
 
 
472 aa  413  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  49.55 
 
 
492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  48.25 
 
 
465 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  48.25 
 
 
465 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  48.77 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  48.68 
 
 
487 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.33 
 
 
474 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  49.23 
 
 
465 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  48.79 
 
 
462 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  42.11 
 
 
461 aa  359  6e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  43.34 
 
 
462 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  42.01 
 
 
475 aa  339  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  42.3 
 
 
458 aa  322  7e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 
474 aa  318  9e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 
453 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  37.28 
 
 
467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  38.28 
 
 
479 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  39.19 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  36.38 
 
 
469 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
497 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 
446 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  34.9 
 
 
463 aa  289  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 
466 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  35.61 
 
 
467 aa  263  6e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 
475 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.68 
 
 
474 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.69 
 
 
465 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.9 
 
 
482 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 
477 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.92 
 
 
471 aa  200  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  30.49 
 
 
526 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.64 
 
 
495 aa  192  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
483 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.51 
 
 
475 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 
522 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 
482 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.51 
 
 
482 aa  186  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 
482 aa  186  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.65 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 
486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 
496 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.69 
 
 
500 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.37 
 
 
534 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.93 
 
 
493 aa  179  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.15 
 
 
483 aa  179  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 
487 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.98 
 
 
462 aa  176  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 
493 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  30.51 
 
 
470 aa  172  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.6 
 
 
503 aa  169  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.02 
 
 
478 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  29.38 
 
 
473 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  29.01 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  29.01 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  29.01 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  29.01 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  29.01 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  29.01 
 
 
457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  27.2 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  27.2 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  28.4 
 
 
516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0856329 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  27.2 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.97 
 
 
512 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  29.01 
 
 
457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  28.21 
 
 
477 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.41 
 
 
493 aa  163  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.76 
 
 
474 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  29.09 
 
 
480 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  28.29 
 
 
490 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  31.53 
 
 
477 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  29.81 
 
 
478 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  28.05 
 
 
457 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.36 
 
 
458 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  29.37 
 
 
457 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  26.63 
 
 
446 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  30.43 
 
 
476 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 
502 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.54 
 
 
462 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.25 
 
 
538 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.26 
 
 
522 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.35 
 
 
477 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
573 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
464 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 
525 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.79 
 
 
457 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.1 
 
 
466 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  26.5 
 
 
475 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.53 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 
478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>