More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2367 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2367  major facilitator transporter  100 
 
 		 478 aa  926    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  61.15 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  61.31 
 
 		 476 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  59.73 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  56.73 
 
 		 491 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  53.17 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  52.95 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2004  major facilitator superfamily MFS_1  58.65 
 
 		 476 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0685608 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1601  major facilitator transporter  51.7 
 
 		 488 aa  349  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 462 aa  313  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  41.96 
 
 		 426 aa  279  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.81 
 
 		 483 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.32 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.06 
 
 		 475 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.22 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.69 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 477 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.77 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.04 
 
 		 456 aa  190  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.55 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.12 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 		 482 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.39 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 465 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.94 
 
 		 496 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  31.78 
 
 		 474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.97 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 462 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  29.12 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  29.12 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  28.88 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  28.88 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.37 
 
 		 512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  27.71 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.84 
 
 		 461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 493 aa  163  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 534 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  30.37 
 
 		 473 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.71 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5625  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 498 aa  159  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 		 480 aa  160  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 497 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.55 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.77 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  27.85 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 455 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 480 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.31 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 455 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.44 
 
 		 474 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 455 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.46 
 
 		 521 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.65 
 
 		 527 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 514 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.02 
 
 		 489 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 609 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  30.38 
 
 		 457 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 495 aa  150  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.11 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 459 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>