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for query gene Sros_3231 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 479 aa  924    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.32 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.17 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.29 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.99 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.95 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.08 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.05 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.53 
 
 		 500 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.47 
 
 		 613 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.26 
 
 		 489 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.14 
 
 		 486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.02 
 
 		 483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  45.47 
 
 		 457 aa  303  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.08 
 
 		 542 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0976  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.62 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.69 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.53 
 
 		 539 aa  273  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.76 
 
 		 516 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  43.27 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.27 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.33 
 
 		 583 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.85 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2240  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.88 
 
 		 478 aa  240  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.14 
 
 		 498 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 		 546 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 		 487 aa  236  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.96 
 
 		 467 aa  233  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.28 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.24 
 
 		 504 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 484 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.22 
 
 		 510 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.94 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.07 
 
 		 489 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 		 477 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.32 
 
 		 488 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0982  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.43 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.08 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.32 
 
 		 522 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 		 478 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.47 
 
 		 458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.4 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.83 
 
 		 469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 		 505 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 520 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.28 
 
 		 532 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 469 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.82 
 
 		 502 aa  210  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.01 
 
 		 478 aa  210  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 		 509 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.62 
 
 		 506 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.54 
 
 		 540 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 506 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 		 529 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 506 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 506 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 527 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 463 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.22 
 
 		 528 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.56 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.47 
 
 		 475 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.6 
 
 		 485 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 523 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.82 
 
 		 478 aa  202  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 483 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 		 763 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.05 
 
 		 525 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.49 
 
 		 507 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
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NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.75 
 
 		 534 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 		 487 aa  200  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
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NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.89 
 
 		 514 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  34.75 
 
 		 514 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  34.76 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.21 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.88 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 		 788 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
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NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  37.16 
 
 		 497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  34.55 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  34.76 
 
 		 511 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  34.76 
 
 		 511 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
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