More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1524 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
546 aa  1046    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0976  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.23 
 
 
537 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  45.04 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 
465 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2240  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 
463 aa  256  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.56 
 
 
492 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.16 
 
 
542 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.96 
 
 
500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.71 
 
 
500 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.73 
 
 
539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.59 
 
 
583 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 
502 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.47 
 
 
480 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.6 
 
 
516 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.85 
 
 
613 aa  221  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.1 
 
 
504 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.18 
 
 
520 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 
471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.41 
 
 
529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 
489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.17 
 
 
498 aa  213  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.7 
 
 
486 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.12 
 
 
522 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 
510 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3231  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.14 
 
 
479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 
504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.27 
 
 
478 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
478 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 
528 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.96 
 
 
469 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.17 
 
 
467 aa  194  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.88 
 
 
478 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.35 
 
 
488 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 
463 aa  190  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 
458 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 
470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.73 
 
 
489 aa  184  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 
486 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 
486 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 
486 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  32.55 
 
 
512 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
505 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 
486 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 
486 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  31.8 
 
 
512 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  31.91 
 
 
463 aa  179  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 
486 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 
502 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  31.8 
 
 
512 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  31.8 
 
 
512 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  31.8 
 
 
512 aa  177  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  31.02 
 
 
537 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.58 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  31.17 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.22 
 
 
520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  31.17 
 
 
512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 
521 aa  174  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 
490 aa  174  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 
489 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
574 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.79 
 
 
626 aa  173  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 
458 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.45 
 
 
519 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.35 
 
 
475 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0982  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.66 
 
 
497 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 
530 aa  172  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 
474 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 
525 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.15 
 
 
505 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.1 
 
 
478 aa  170  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.08 
 
 
532 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.68 
 
 
478 aa  170  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.22 
 
 
522 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.51 
 
 
483 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 
531 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.93 
 
 
485 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 
522 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2027  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
506 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  31.38 
 
 
516 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  31.21 
 
 
516 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 
522 aa  167  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  30.38 
 
 
514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.9 
 
 
583 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.35 
 
 
498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 
534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
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NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  27.38 
 
 
534 aa  164  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.23 
 
 
493 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 
520 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.98 
 
 
475 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  32.71 
 
 
468 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  32.71 
 
 
468 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 
524 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 
472 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  29.16 
 
 
500 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.74 
 
 
468 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.21 
 
 
534 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
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NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  29.38 
 
 
530 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
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