More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5842 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  88.84 
 
 		 443 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  100 
 
 		 456 aa  865    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4168  major facilitator transporter  83.14 
 
 		 474 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4992  major facilitator superfamily MFS_1  67.86 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.942252  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3932  major facilitator superfamily MFS_1  64.07 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.152264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3819  major facilitator superfamily MFS_1  64.07 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2892  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5226  major facilitator transporter  59.86 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5075  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.411558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.76 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4804  major facilitator transporter  53.85 
 
 		 429 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.52 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 		 522 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.21 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 		 458 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 484 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.32 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 		 485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.56 
 
 		 469 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 486 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 486 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 486 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 486 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 486 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 486 aa  210  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  37.98 
 
 		 467 aa  209  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 		 458 aa  209  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.07 
 
 		 520 aa  209  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 		 489 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.2 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 468 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 483 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 483 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.05 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.64 
 
 		 583 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 		 540 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 523 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.8 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.93 
 
 		 539 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.41 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 474 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 507 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 512 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.49 
 
 		 520 aa  199  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  36.54 
 
 		 537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 		 534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.73 
 
 		 500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 512 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 512 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.17 
 
 		 508 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.1 
 
 		 522 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.56 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 		 475 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.22 
 
 		 471 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 505 aa  193  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.88 
 
 		 458 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 512 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 512 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.58 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.88 
 
 		 500 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.11 
 
 		 469 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 		 489 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.05 
 
 		 503 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 		 474 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.64 
 
 		 502 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.02 
 
 		 466 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 		 492 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 477 aa  186  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 506 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.64 
 
 		 506 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 		 506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.73 
 
 		 519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 		 478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.88 
 
 		 525 aa  183  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.1 
 
 		 529 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 511 aa  183  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  32.22 
 
 		 523 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>