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for query gene Krad_2778 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2778  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 547 aa  1019    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.581095  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.33 
 
 		 522 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.76 
 
 		 532 aa  279  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.1 
 
 		 524 aa  276  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.35 
 
 		 528 aa  264  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  36.25 
 
 		 530 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.64 
 
 		 520 aa  257  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 		 529 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5607  drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  36.11 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864613  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.62 
 
 		 489 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.78 
 
 		 522 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.68 
 
 		 502 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.56 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 		 539 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.24 
 
 		 788 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.73 
 
 		 569 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 		 607 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.74 
 
 		 697 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.83 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.14 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.82 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  30.67 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.99 
 
 		 452 aa  181  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.35 
 
 		 458 aa  181  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 468 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 468 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 		 478 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.64 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.08 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 		 484 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 478 aa  177  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 		 672 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 506 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 506 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 		 490 aa  173  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 505 aa  173  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 		 500 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 519 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.22 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.41 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.21 
 
 		 525 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 		 488 aa  170  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.31 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.79 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.21 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 		 685 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.79 
 
 		 763 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  30.2 
 
 		 1062 aa  168  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 517 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 		 522 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.66 
 
 		 579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.74 
 
 		 508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.75 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  32.41 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.59 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.37 
 
 		 524 aa  163  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 528 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  33.41 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.7 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 511 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.55 
 
 		 641 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.89 
 
 		 529 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  33.33 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 		 685 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.01 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
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NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 678 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
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NC_013595  Sros_3154  RemN protein  32.87 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  30.84 
 
 		 534 aa  158  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 485 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
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NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
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NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
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NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.23 
 
 		 528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.89 
 
 		 493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.53 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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