More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1034 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1007  major facilitator transporter  99.63 
 
 
536 aa  1042    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1024  major facilitator superfamily transporter  99.63 
 
 
536 aa  1042    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1034  major facilitator transporter  100 
 
 
536 aa  1045    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5055  major facilitator transporter  85.25 
 
 
524 aa  805    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4140  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.52 
 
 
505 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0890  major facilitator superfamily MFS_1  42.99 
 
 
565 aa  330  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.13 
 
 
534 aa  311  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  39.92 
 
 
523 aa  290  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 
607 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.65 
 
 
525 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 
533 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.4 
 
 
520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8705  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.17 
 
 
544 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.26 
 
 
522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.23 
 
 
522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5160  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.21 
 
 
509 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.33 
 
 
532 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.03 
 
 
503 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
503 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 
538 aa  223  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.71 
 
 
520 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.92 
 
 
519 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 
519 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.56 
 
 
531 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3498  major facilitator transporter  33.13 
 
 
514 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 
534 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 
507 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  32.33 
 
 
537 aa  206  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.92 
 
 
474 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.55 
 
 
626 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0020  major facilitator transporter  34.67 
 
 
515 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.74 
 
 
532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.18 
 
 
518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  34.34 
 
 
502 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 
489 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
511 aa  196  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.04 
 
 
524 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 
522 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 
539 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  37.68 
 
 
514 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.13 
 
 
516 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.87 
 
 
525 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  33.4 
 
 
530 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 
516 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  31.82 
 
 
509 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 
478 aa  189  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 
478 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 
484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  32.6 
 
 
503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.43 
 
 
488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  30.57 
 
 
584 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 
510 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 
522 aa  183  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.56 
 
 
486 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.56 
 
 
486 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.56 
 
 
486 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.58 
 
 
478 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.56 
 
 
486 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.56 
 
 
486 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 
478 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.56 
 
 
486 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.93 
 
 
487 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 
478 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  31.48 
 
 
490 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 
494 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
509 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 
502 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  31.9 
 
 
519 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  32.56 
 
 
504 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 
478 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.96 
 
 
489 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
500 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 
475 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 
529 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2027  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 
506 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.79 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.48 
 
 
488 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  33.4 
 
 
533 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 
468 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.93 
 
 
480 aa  173  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
555 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 
491 aa  171  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  31.4 
 
 
528 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
517 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  33.4 
 
 
526 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 
527 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2521  major facilitator transporter  31.04 
 
 
497 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 
500 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
536 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 
508 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
524 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  31.35 
 
 
535 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  31.87 
 
 
500 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.46 
 
 
478 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>