More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1259 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 539 aa  1010    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  55.6 
 
 		 524 aa  492  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  51.66 
 
 		 526 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  59.6 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  57.09 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 		 518 aa  448  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  55.4 
 
 		 513 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  54.16 
 
 		 521 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  50.87 
 
 		 528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  53.18 
 
 		 558 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  53 
 
 		 529 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  54.62 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  52.74 
 
 		 536 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  58.53 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  51.56 
 
 		 508 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  46.73 
 
 		 562 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  50.89 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  49.04 
 
 		 588 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  48.79 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  57.6 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  52.29 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  51.2 
 
 		 575 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  51.2 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  54.26 
 
 		 516 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 514 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  47.61 
 
 		 553 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 584 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  45.29 
 
 		 516 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 		 535 aa  363  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  48.77 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.73 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  52.31 
 
 		 477 aa  359  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 525 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  44.57 
 
 		 525 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 525 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  47.32 
 
 		 601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  50.64 
 
 		 521 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 532 aa  356  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  48.84 
 
 		 563 aa  356  6.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  49.31 
 
 		 513 aa  353  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 503 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  46.69 
 
 		 554 aa  350  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 		 490 aa  348  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  50.55 
 
 		 528 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 533 aa  341  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 513 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 524 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  44.89 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  42.51 
 
 		 535 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  41.75 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 		 536 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 517 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  43.23 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 511 aa  270  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  39.92 
 
 		 517 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 514 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 		 520 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 500 aa  259  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  39.64 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 503 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  37.23 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 495 aa  248  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 594 aa  247  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.21 
 
 		 534 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  41.37 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.48 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.08 
 
 		 538 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 		 506 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 		 496 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.73 
 
 		 519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 		 511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  38.98 
 
 		 501 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 516 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.26 
 
 		 503 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 501 aa  230  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 494 aa  229  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 519 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 503 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 		 522 aa  223  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  36.09 
 
 		 501 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  35.41 
 
 		 495 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  35.41 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  35.41 
 
 		 495 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  35.41 
 
 		 495 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 		 510 aa  216  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  35.41 
 
 		 495 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>