More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 508 aa  977    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  69.38 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  67.4 
 
 		 516 aa  532  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  59.11 
 
 		 540 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  49.71 
 
 		 526 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  49.47 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  51.19 
 
 		 513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  49.9 
 
 		 521 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 558 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  53.11 
 
 		 481 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  51.97 
 
 		 539 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 536 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  55.03 
 
 		 502 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 518 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  49.09 
 
 		 517 aa  379  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 		 562 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 501 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  45.7 
 
 		 528 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 		 553 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  45.72 
 
 		 588 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.27 
 
 		 537 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 		 513 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  45.02 
 
 		 509 aa  342  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  47.9 
 
 		 521 aa  342  7e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 532 aa  342  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  44.18 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 		 509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 		 528 aa  337  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  43.11 
 
 		 541 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  43.59 
 
 		 535 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 514 aa  326  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 		 519 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 584 aa  323  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 513 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 575 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 601 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 525 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  42.86 
 
 		 525 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 525 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  44.56 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  49.11 
 
 		 563 aa  315  9e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 533 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  44.03 
 
 		 524 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  46.37 
 
 		 497 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 477 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  42.77 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  41.86 
 
 		 490 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 		 506 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  43.59 
 
 		 508 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 514 aa  292  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 555 aa  286  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  40.77 
 
 		 535 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 517 aa  269  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 500 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 		 536 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 		 516 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 500 aa  253  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  37.3 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  37.96 
 
 		 500 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 511 aa  246  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  39.62 
 
 		 517 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 510 aa  243  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  39.48 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  41.7 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 520 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.95 
 
 		 503 aa  228  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  40.52 
 
 		 528 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 594 aa  226  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 503 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 525 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.05 
 
 		 534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 515 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.15 
 
 		 522 aa  212  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  38.23 
 
 		 501 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 		 506 aa  210  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  36.38 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 		 520 aa  206  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  36.56 
 
 		 501 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  32.9 
 
 		 495 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  32.69 
 
 		 495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  32.69 
 
 		 495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  33.05 
 
 		 495 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  32.69 
 
 		 495 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 501 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.33 
 
 		 532 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 626 aa  193  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 507 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>