More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1689 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  100 
 
 		 495 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  99.8 
 
 		 495 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  99.8 
 
 		 495 aa  957    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  79.76 
 
 		 494 aa  721    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  100 
 
 		 495 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  99.6 
 
 		 495 aa  954    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  45.04 
 
 		 513 aa  360  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 		 523 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 504 aa  312  9e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  42.19 
 
 		 528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 500 aa  302  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 495 aa  299  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 500 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 		 517 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  43.58 
 
 		 528 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 514 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 525 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  39.68 
 
 		 525 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 525 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  35.57 
 
 		 500 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  36.85 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 524 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  39.78 
 
 		 501 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  43.49 
 
 		 517 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 513 aa  266  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 501 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  38.56 
 
 		 505 aa  260  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  37.15 
 
 		 535 aa  259  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  38.43 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 532 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 588 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 519 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 528 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 		 555 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 521 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 517 aa  243  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 521 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 518 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 562 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.35 
 
 		 537 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 584 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 511 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 529 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 513 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 516 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 536 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 508 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 514 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.39 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 535 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  36.27 
 
 		 501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 501 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 501 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 601 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 520 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 509 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 496 aa  206  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.79 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  33.27 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  31.98 
 
 		 508 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  33.47 
 
 		 516 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.52 
 
 		 503 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 519 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  36.4 
 
 		 510 aa  200  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 540 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 563 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 594 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 503 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 528 aa  192  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 516 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 520 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 528 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 507 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 511 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 558 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>