More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5250 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 477 aa  900    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  75.49 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  53.81 
 
 		 521 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  47.43 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  51.6 
 
 		 518 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  53.88 
 
 		 517 aa  359  7e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  49.27 
 
 		 528 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  48.89 
 
 		 514 aa  352  8.999999999999999e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  51.11 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  52.04 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 		 588 aa  336  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  46.09 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  49.26 
 
 		 526 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  52.33 
 
 		 536 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  54.26 
 
 		 496 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  48.64 
 
 		 509 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  52.35 
 
 		 509 aa  332  8e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 540 aa  332  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 509 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  49.63 
 
 		 501 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  52.96 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 553 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  45.44 
 
 		 528 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  46.94 
 
 		 541 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  52.31 
 
 		 539 aa  316  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  48.91 
 
 		 575 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 509 aa  309  5.9999999999999995e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  52.28 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 532 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 584 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  51.58 
 
 		 528 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.34 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 		 521 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  45.99 
 
 		 508 aa  299  7e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  48.48 
 
 		 514 aa  299  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  46.96 
 
 		 513 aa  296  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 		 516 aa  293  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 525 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  45.19 
 
 		 525 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 525 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  48.26 
 
 		 513 aa  289  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  48.02 
 
 		 524 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  45.72 
 
 		 503 aa  285  9e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  47.24 
 
 		 554 aa  283  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 		 497 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 		 601 aa  279  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  44.18 
 
 		 533 aa  276  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 490 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 563 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 508 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  42.62 
 
 		 535 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 555 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 500 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  45.99 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 500 aa  247  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  46.14 
 
 		 536 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 516 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  40.49 
 
 		 517 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  41.25 
 
 		 528 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  40.63 
 
 		 516 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  39.01 
 
 		 500 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  38.14 
 
 		 492 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  41.28 
 
 		 594 aa  220  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 504 aa  212  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 		 511 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  36.89 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.97 
 
 		 522 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 495 aa  200  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.71 
 
 		 626 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 515 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 516 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 523 aa  193  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 494 aa  193  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 		 538 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  37.31 
 
 		 501 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  37.31 
 
 		 510 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 501 aa  189  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.81 
 
 		 534 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.82 
 
 		 525 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.64 
 
 		 520 aa  186  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 519 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  36.87 
 
 		 501 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 507 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 510 aa  173  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 519 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.63 
 
 		 607 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 		 532 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>