More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0194 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
523 aa  1014    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  56.82 
 
 
513 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  44.51 
 
 
495 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  44.51 
 
 
495 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  44.51 
 
 
495 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  44.51 
 
 
495 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  44.51 
 
 
495 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  44.51 
 
 
494 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  43.28 
 
 
514 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  40 
 
 
503 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 
500 aa  319  9e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 
500 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  38.55 
 
 
495 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  39.08 
 
 
500 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  43.13 
 
 
504 aa  296  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  41.45 
 
 
517 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  43.75 
 
 
501 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  43.41 
 
 
501 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  43.14 
 
 
528 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 
517 aa  259  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 
509 aa  256  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  38.35 
 
 
594 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  38.09 
 
 
554 aa  243  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 
496 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
516 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.16 
 
 
537 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  37.52 
 
 
528 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  35.81 
 
 
525 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  35.81 
 
 
525 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  35.81 
 
 
525 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  35.33 
 
 
533 aa  237  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 
524 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 
513 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  38.59 
 
 
510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
588 aa  230  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  38.08 
 
 
526 aa  230  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  36.67 
 
 
505 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
501 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
529 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  34.96 
 
 
535 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  36.19 
 
 
501 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 
518 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  36.24 
 
 
509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 
510 aa  223  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 
508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 
516 aa  220  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  37.14 
 
 
532 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  37.6 
 
 
509 aa  217  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
521 aa  216  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
519 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
562 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 
490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  32.87 
 
 
509 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 
503 aa  210  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  33.89 
 
 
528 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
513 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
524 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 
536 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
553 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
521 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
516 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
511 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
501 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 
539 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  32.84 
 
 
540 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
525 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  34.95 
 
 
575 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  33.6 
 
 
514 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 
477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 
520 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.47 
 
 
503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
541 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
510 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  36.9 
 
 
508 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
506 aa  193  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 
535 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.88 
 
 
534 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
503 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 
519 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
496 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 
516 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  33.33 
 
 
558 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  31.33 
 
 
481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 
538 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  33.95 
 
 
584 aa  179  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  31.32 
 
 
536 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
601 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  34.8 
 
 
492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  33.25 
 
 
463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.47 
 
 
519 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.64 
 
 
607 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 
514 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 
528 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 
497 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 
511 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.06 
 
 
626 aa  170  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>