More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0742 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  100 
 
 
474 aa  930    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  42.76 
 
 
474 aa  349  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  39.15 
 
 
467 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  39.11 
 
 
467 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  38.58 
 
 
467 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  38.58 
 
 
467 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  38.58 
 
 
467 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  39.21 
 
 
484 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
486 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  36.57 
 
 
475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
479 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2807  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 
474 aa  220  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  32.08 
 
 
479 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3000  major facilitator transporter  31.72 
 
 
465 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3046  major facilitator superfamily transporter  31.72 
 
 
465 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.958092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3015  major facilitator transporter  31.94 
 
 
465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.0182564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3349  major facilitator superfamily transporter  30.77 
 
 
473 aa  176  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11650  drug efflux membrane protein  30.13 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.306969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  27.78 
 
 
458 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  27.79 
 
 
492 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  28.54 
 
 
484 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.43 
 
 
479 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.43 
 
 
479 aa  113  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.43 
 
 
469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.43 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.43 
 
 
478 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 
495 aa  110  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 
478 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 
478 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 
478 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
448 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  25.89 
 
 
445 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.77 
 
 
650 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  26.78 
 
 
487 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.1 
 
 
685 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  24.75 
 
 
548 aa  106  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.37 
 
 
685 aa  106  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.91 
 
 
480 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.82 
 
 
682 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.82 
 
 
682 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.82 
 
 
682 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.36 
 
 
697 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.64 
 
 
539 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
502 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  21.73 
 
 
494 aa  98.2  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 
569 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.17 
 
 
495 aa  97.8  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.06 
 
 
531 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 
531 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  25.06 
 
 
531 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  25.06 
 
 
531 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.06 
 
 
531 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26 
 
 
678 aa  97.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.53 
 
 
489 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.06 
 
 
549 aa  96.7  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 
549 aa  96.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.2 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.15 
 
 
500 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 
554 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.67 
 
 
495 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.73 
 
 
519 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.33 
 
 
511 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  25.2 
 
 
511 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.33 
 
 
511 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  25.16 
 
 
486 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.26 
 
 
531 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  25.21 
 
 
535 aa  93.6  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
491 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.2 
 
 
511 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  25.2 
 
 
511 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.67 
 
 
511 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
512 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 
489 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.11 
 
 
680 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
496 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 
549 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 
491 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.76 
 
 
532 aa  90.9  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  22.12 
 
 
531 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.35 
 
 
504 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.35 
 
 
511 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  27.78 
 
 
488 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.74 
 
 
466 aa  90.1  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.09 
 
 
511 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
496 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
512 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
484 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 
508 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.29 
 
 
508 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
500 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.92 
 
 
491 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2200  major facilitator transporter  25.16 
 
 
447 aa  88.6  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0335297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.09 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2238  major facilitator transporter  25.16 
 
 
447 aa  88.6  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000374432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.43 
 
 
501 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  24.93 
 
 
507 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  22.44 
 
 
531 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  25.24 
 
 
500 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  22.55 
 
 
531 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>