More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11650 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11650  drug efflux membrane protein  100 
 
 
471 aa  894    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.306969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3349  major facilitator superfamily transporter  63.66 
 
 
473 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3000  major facilitator transporter  62.23 
 
 
465 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3046  major facilitator superfamily transporter  62.23 
 
 
465 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.958092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3015  major facilitator transporter  62.02 
 
 
465 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.0182564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  44.28 
 
 
479 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2807  major facilitator superfamily MFS_1  44.11 
 
 
474 aa  282  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  34.57 
 
 
474 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  38.9 
 
 
467 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  36.24 
 
 
484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  38.44 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  37.82 
 
 
467 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 
479 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  37.18 
 
 
467 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  37.18 
 
 
467 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  30.13 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  37.98 
 
 
475 aa  196  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  31.77 
 
 
492 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  31.17 
 
 
458 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  30.98 
 
 
484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.64 
 
 
685 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.51 
 
 
697 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 
682 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 
682 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 
682 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 
685 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.77 
 
 
650 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 
532 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.82 
 
 
680 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  26.81 
 
 
531 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  26.81 
 
 
531 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  27.64 
 
 
531 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  27.41 
 
 
531 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  26.81 
 
 
531 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  27.88 
 
 
531 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 
531 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 
531 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.83 
 
 
531 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.83 
 
 
531 aa  97.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.24 
 
 
549 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.83 
 
 
549 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  29.24 
 
 
531 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  29.24 
 
 
531 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  27.88 
 
 
531 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  35.65 
 
 
462 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 
508 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.46 
 
 
549 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4062  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.56 
 
 
531 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671789  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.11 
 
 
539 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2926  multidrug transporter, putative  36.72 
 
 
519 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0138273  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
530 aa  90.5  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
530 aa  90.5  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.14 
 
 
541 aa  90.1  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  35.75 
 
 
537 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.79 
 
 
504 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  28.67 
 
 
548 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.38 
 
 
565 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 
491 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.49 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  34.08 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  24.25 
 
 
537 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  24.25 
 
 
537 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.55 
 
 
522 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.71 
 
 
519 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.62 
 
 
537 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.73 
 
 
498 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 
890 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  23.75 
 
 
476 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  23.75 
 
 
537 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.75 
 
 
537 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  23.75 
 
 
537 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.45 
 
 
491 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  23.75 
 
 
537 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  23.75 
 
 
537 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09291  MFS transporter/NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  29.33 
 
 
1429 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.612023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.77 
 
 
592 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.4 
 
 
592 aa  81.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  27.06 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 
505 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  26.15 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
491 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  34.46 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 
538 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.36 
 
 
569 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.96 
 
 
554 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  32.61 
 
 
539 aa  77.8  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.41 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
489 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 
545 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.47 
 
 
476 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>