More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0847 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  100 
 
 		 458 aa  866    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 474 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  35.11 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  32.64 
 
 		 467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  31.35 
 
 		 484 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2807  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 467 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 467 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3349  major facilitator superfamily transporter  31.34 
 
 		 473 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3015  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 465 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.0182564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3000  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3046  major facilitator superfamily transporter  31.48 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.958092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  27.9 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11650  drug efflux membrane protein  34.52 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.306969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.98 
 
 		 495 aa  103  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.9 
 
 		 685 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 		 682 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 		 682 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 		 682 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.66 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.98 
 
 		 592 aa  96.7  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 		 501 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 		 519 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.36 
 
 		 569 aa  94.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 496 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.06 
 
 		 680 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 489 aa  94  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 491 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.18 
 
 		 495 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.23 
 
 		 650 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.69 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 		 537 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 491 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 496 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.1 
 
 		 678 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 484 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.85 
 
 		 535 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 480 aa  87.4  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 515 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.07 
 
 		 685 aa  87  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.65 
 
 		 697 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.36 
 
 		 672 aa  85.1  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.1 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.28 
 
 		 538 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  23.89 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.48 
 
 		 530 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.43 
 
 		 523 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  22.51 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 523 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 		 676 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.06 
 
 		 918 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.38 
 
 		 565 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.17 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.81 
 
 		 526 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.81 
 
 		 526 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 548 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 486 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.37 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.98 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 243 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1958  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1525  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  21.5 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32634  multidrug-resistance transporte  29.94 
 
 		 607 aa  78.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0035637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.93 
 
 		 528 aa  78.2  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5086  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190759  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.9 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  30.43 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 685 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  33.09 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>