More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1717 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  100 
 
 		 462 aa  875    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  48.5 
 
 		 489 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  44.82 
 
 		 464 aa  273  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 483 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  41.14 
 
 		 515 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  37.96 
 
 		 462 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 445 aa  230  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 461 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 		 498 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  36.99 
 
 		 495 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  38.26 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  32.21 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  38.18 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 489 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.88 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 487 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 491 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 491 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.73 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  25.44 
 
 		 487 aa  103  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 489 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 449 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.18 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 		 478 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 		 478 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.36 
 
 		 476 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 486 aa  100  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.18 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.18 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 501 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3297  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.94 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.48 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  24.94 
 
 		 478 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.55 
 
 		 535 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.6 
 
 		 469 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.24 
 
 		 538 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.18 
 
 		 565 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.63 
 
 		 495 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 531 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  24.1 
 
 		 507 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 511 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.07 
 
 		 495 aa  94  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.06 
 
 		 621 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 539 aa  94  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 448 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.27 
 
 		 523 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 531 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 531 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 484 aa  91.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  23.37 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08095  MFS toxin efflux pump (AflT), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12620)  27.05 
 
 		 539 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00148493  normal  0.123632 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 243 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 531 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 531 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 531 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.82 
 
 		 506 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 549 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 496 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  27.03 
 
 		 531 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  27.03 
 
 		 531 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  22.43 
 
 		 537 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 531 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.57 
 
 		 549 aa  88.2  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  22.43 
 
 		 537 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.62 
 
 		 531 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  22.87 
 
 		 476 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  35.16 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.56 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  26.56 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  26.56 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  26.56 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  22.35 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.19 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  22.87 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.92 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  22.87 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.62 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.06 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.92 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.53 
 
 		 565 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>