More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26390 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 495 aa  926    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  42.83 
 
 		 504 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 483 aa  289  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  44.98 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  43.72 
 
 		 462 aa  266  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 489 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 461 aa  229  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  36.96 
 
 		 462 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  41.85 
 
 		 515 aa  223  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  39.8 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 461 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 465 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  27.74 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  33.05 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 490 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.34 
 
 		 541 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0727  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 476 aa  97.1  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.24 
 
 		 476 aa  97.4  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 501 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 497 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 496 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.45 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.45 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.95 
 
 		 479 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.38 
 
 		 538 aa  94.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.45 
 
 		 478 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  25.45 
 
 		 478 aa  94.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.45 
 
 		 478 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 511 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.45 
 
 		 478 aa  94  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 481 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  33.71 
 
 		 487 aa  93.6  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 496 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.19 
 
 		 479 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  28 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.38 
 
 		 565 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.19 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 548 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 491 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 491 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.06 
 
 		 495 aa  90.1  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.89 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.81 
 
 		 491 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.41 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.73 
 
 		 502 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.54 
 
 		 495 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  29.71 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 531 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 474 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 484 aa  87  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 243 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.34 
 
 		 641 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.96 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 531 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  27.59 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.07 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  27.16 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.98 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.25 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  26.95 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.07 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.07 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.07 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  26.95 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.91 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.82 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  24.11 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  24.31 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  24.11 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  28.66 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.31 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 		 890 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  24.08 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  24.11 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>