More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1255 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  100 
 
 		 492 aa  963    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  46.62 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  33.64 
 
 		 467 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 484 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 467 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 479 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 486 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 474 aa  156  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3000  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3046  major facilitator superfamily transporter  31.61 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.958092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3015  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 465 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.0182564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  30.96 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  31.22 
 
 		 479 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 697 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3349  major facilitator superfamily transporter  32.46 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11650  drug efflux membrane protein  31.13 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.306969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 515 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 		 682 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 		 682 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 		 682 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 685 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 		 650 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.44 
 
 		 678 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 501 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2807  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 474 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.01 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  25.86 
 
 		 548 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  27.67 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 497 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  29.35 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  26.7 
 
 		 549 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 532 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.7 
 
 		 549 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 525 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.34 
 
 		 685 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.41 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  24.88 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  27.25 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  27.25 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.25 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.88 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.25 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  24.63 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.86 
 
 		 569 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 548 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 		 485 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.72 
 
 		 526 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.57 
 
 		 592 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.72 
 
 		 526 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.63 
 
 		 478 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 522 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  26.91 
 
 		 515 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 680 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.63 
 
 		 479 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5733  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 494 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.883697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.63 
 
 		 479 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 531 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.16 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.54 
 
 		 549 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  27.54 
 
 		 501 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 528 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 531 aa  97.8  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 530 aa  97.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.87 
 
 		 535 aa  97.1  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 530 aa  97.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.83 
 
 		 530 aa  96.3  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.26 
 
 		 495 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 531 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2444  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.18 
 
 		 495 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.5 
 
 		 516 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.29 
 
 		 517 aa  95.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 539 aa  95.1  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 539 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.74 
 
 		 531 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 531 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4436  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 502 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.93 
 
 		 890 aa  92.8  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 512 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>