More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1591 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  99.57 
 
 
467 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  99.57 
 
 
467 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  97.32 
 
 
467 aa  810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  89.72 
 
 
467 aa  791    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  100 
 
 
467 aa  886    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  60.55 
 
 
486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  50.22 
 
 
474 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  53.5 
 
 
484 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  38.46 
 
 
474 aa  332  8e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  47.74 
 
 
475 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
479 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3000  major facilitator transporter  39.83 
 
 
465 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3046  major facilitator superfamily transporter  39.83 
 
 
465 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.958092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3015  major facilitator transporter  39.62 
 
 
465 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.0182564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  37.83 
 
 
479 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3349  major facilitator superfamily transporter  37.74 
 
 
473 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  34.29 
 
 
492 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11650  drug efflux membrane protein  37.61 
 
 
471 aa  192  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.306969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2807  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 
474 aa  189  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  30.47 
 
 
484 aa  183  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  32.13 
 
 
458 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 
515 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.91 
 
 
495 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  27.87 
 
 
531 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.39 
 
 
495 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.06 
 
 
500 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  29.22 
 
 
471 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  27.53 
 
 
468 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 
531 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.5 
 
 
531 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 
489 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.5 
 
 
531 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  29.29 
 
 
469 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  28.5 
 
 
531 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.5 
 
 
549 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 
682 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  28.5 
 
 
531 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 
682 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 
682 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.75 
 
 
676 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 
549 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  27.63 
 
 
531 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.09 
 
 
680 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 
685 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
491 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  26.98 
 
 
531 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  26.98 
 
 
531 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
491 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.43 
 
 
593 aa  103  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 
519 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 
489 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  27.27 
 
 
531 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  27.1 
 
 
531 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  26.74 
 
 
531 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 
650 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 
485 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 
685 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.61 
 
 
554 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 
890 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.81 
 
 
501 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  29.38 
 
 
461 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
523 aa  100  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03264  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03320)  36.06 
 
 
571 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.591417 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  22.22 
 
 
445 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
464 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 
495 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  32.78 
 
 
539 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
548 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.22 
 
 
528 aa  98.2  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.89 
 
 
541 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 
678 aa  97.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.21 
 
 
539 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.84 
 
 
918 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  26.85 
 
 
548 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 
532 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 
549 aa  94.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.29 
 
 
538 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 
491 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.43 
 
 
539 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.36 
 
 
538 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2926  multidrug transporter, putative  30.87 
 
 
519 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0138273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 
530 aa  93.6  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.78 
 
 
569 aa  93.6  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.76 
 
 
531 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 
561 aa  93.2  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.8 
 
 
592 aa  93.2  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.4 
 
 
666 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.85 
 
 
476 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4436  major facilitator transporter  27.27 
 
 
502 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.22 
 
 
479 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.49 
 
 
480 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  27.66 
 
 
477 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
508 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2812  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.99 
 
 
1102 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.220309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  27.76 
 
 
486 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.22 
 
 
479 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  22.95 
 
 
478 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 
448 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.46 
 
 
478 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>