More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1768 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  100 
 
 
445 aa  870    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2200  major facilitator transporter  73.26 
 
 
447 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0335297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2238  major facilitator transporter  73.26 
 
 
447 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000374432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 
448 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
484 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  28.92 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28 
 
 
592 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 
506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 
491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 
502 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
539 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 
489 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.56 
 
 
495 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
491 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
491 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 
495 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  29.02 
 
 
477 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  27.46 
 
 
500 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.01 
 
 
476 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
496 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
496 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 
500 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 
485 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 
480 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 
607 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.48 
 
 
479 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 
478 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0482  major facilitator superfamily permease  28.47 
 
 
497 aa  144  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110458  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 
501 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.48 
 
 
479 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2618  major facilitator transporter  29.46 
 
 
484 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.876226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  29.03 
 
 
490 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 
495 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 
478 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  28.48 
 
 
478 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 
478 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  28.48 
 
 
478 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.47 
 
 
491 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 
493 aa  140  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.4 
 
 
528 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.09 
 
 
469 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.33 
 
 
538 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28 
 
 
890 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 
541 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.23 
 
 
590 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 
569 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.08 
 
 
535 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  26.24 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  27.11 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  28.1 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  28.77 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.34 
 
 
538 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  25.73 
 
 
487 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 
513 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.84 
 
 
539 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0064  major facilitator transporter  27.43 
 
 
482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000292111 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0727  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
476 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0060  major facilitator transporter  27.43 
 
 
482 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 
511 aa  134  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.4 
 
 
513 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  27.4 
 
 
513 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  27.4 
 
 
513 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.4 
 
 
513 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.4 
 
 
513 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 
513 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.16 
 
 
513 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.16 
 
 
513 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.16 
 
 
513 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 
512 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  26.39 
 
 
476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0062  major facilitator transporter  27.18 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  26.39 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  26.39 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  26.39 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
538 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  26.39 
 
 
537 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0244  major facilitator superfamily permease  27.36 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00531035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 
537 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 
526 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  26.39 
 
 
537 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  26.15 
 
 
537 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1525  major facilitator transporter  26.59 
 
 
519 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  25.69 
 
 
478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 
477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1000  major facilitator transporter  30.74 
 
 
531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  25.29 
 
 
507 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.39 
 
 
537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 
516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3998  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.58 
 
 
550 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 
509 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
497 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  25.12 
 
 
535 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 
471 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 
565 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>