More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1000 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1000  major facilitator transporter  100 
 
 		 531 aa  1017    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  43.31 
 
 		 535 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.66 
 
 		 569 aa  339  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.78 
 
 		 666 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.51 
 
 		 676 aa  326  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.57 
 
 		 558 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.38 
 
 		 535 aa  315  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  42.41 
 
 		 666 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.04 
 
 		 680 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.61 
 
 		 554 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.41 
 
 		 672 aa  297  4e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.78 
 
 		 504 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.82 
 
 		 504 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.62 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.07 
 
 		 522 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.13 
 
 		 509 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.13 
 
 		 509 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.35 
 
 		 509 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.67 
 
 		 525 aa  290  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.61 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.01 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 		 525 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.31 
 
 		 509 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.71 
 
 		 504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.82 
 
 		 504 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.68 
 
 		 505 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.92 
 
 		 504 aa  282  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.21 
 
 		 504 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.21 
 
 		 504 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.21 
 
 		 504 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.1 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.96 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.96 
 
 		 504 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.96 
 
 		 504 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.96 
 
 		 504 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.14 
 
 		 523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.5 
 
 		 682 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.67 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 		 572 aa  274  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.62 
 
 		 697 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.94 
 
 		 526 aa  273  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.22 
 
 		 530 aa  272  9e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 		 682 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 		 682 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.26 
 
 		 528 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.28 
 
 		 528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.17 
 
 		 567 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.4 
 
 		 593 aa  269  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.26 
 
 		 555 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  37.59 
 
 		 537 aa  266  8e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 		 534 aa  266  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.12 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.93 
 
 		 678 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.85 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.96 
 
 		 641 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 		 530 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 		 685 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.88 
 
 		 650 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 		 538 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  37.75 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.07 
 
 		 538 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.37 
 
 		 592 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.03 
 
 		 566 aa  259  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.77 
 
 		 483 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 		 685 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 491 aa  259  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 		 523 aa  259  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.49 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.17 
 
 		 483 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.17 
 
 		 539 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  38.85 
 
 		 515 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.17 
 
 		 504 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.63 
 
 		 607 aa  257  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 		 483 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.14 
 
 		 918 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.38 
 
 		 571 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.16 
 
 		 565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.89 
 
 		 541 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 		 584 aa  253  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 494 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  36.19 
 
 		 535 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.82 
 
 		 519 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 		 562 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 		 532 aa  250  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.61 
 
 		 592 aa  249  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
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NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 528 aa  249  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.26 
 
 		 526 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  38.2 
 
 		 1062 aa  249  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_3777  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.24 
 
 		 554 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 685 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
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NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.25 
 
 		 575 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
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NC_013093  Amir_2523  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 551 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 514 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.34 
 
 		 498 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
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NC_008541  Arth_3998  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 		 550 aa  247  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.12 
 
 		 500 aa  246  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 537 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
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NC_007778  RPB_3496  MFS transporter  41.39 
 
 		 531 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597192  normal  1 
 
 
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