More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3000 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3000  major facilitator transporter  100 
 
 		 465 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3046  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 465 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.958092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3015  major facilitator transporter  98.49 
 
 		 465 aa  873    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.0182564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3349  major facilitator superfamily transporter  73.49 
 
 		 473 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11650  drug efflux membrane protein  62.23 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.306969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  48.72 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2807  major facilitator superfamily MFS_1  49.17 
 
 		 474 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  40.79 
 
 		 467 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 474 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 467 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 484 aa  226  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 486 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 474 aa  221  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 479 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  51.19 
 
 		 475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  31.26 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 458 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.49 
 
 		 697 aa  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 		 680 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 685 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  25.53 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.36 
 
 		 531 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.72 
 
 		 650 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 		 678 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 548 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.97 
 
 		 501 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 531 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.65 
 
 		 539 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.26 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 531 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 531 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 		 508 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 682 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.06 
 
 		 541 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 682 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 682 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 685 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 531 aa  96.7  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 461 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.26 
 
 		 495 aa  96.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 549 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  29.88 
 
 		 531 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  29.88 
 
 		 531 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  27.48 
 
 		 548 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.64 
 
 		 511 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.94 
 
 		 538 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4062  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.67 
 
 		 531 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.2 
 
 		 549 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.62 
 
 		 676 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.65 
 
 		 531 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.65 
 
 		 531 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.65 
 
 		 549 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.65 
 
 		 531 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.61 
 
 		 504 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 592 aa  92.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.19 
 
 		 565 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.41 
 
 		 513 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.41 
 
 		 513 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  28.4 
 
 		 666 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.27 
 
 		 513 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  23.27 
 
 		 513 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  27.54 
 
 		 515 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.27 
 
 		 513 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.27 
 
 		 513 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 532 aa  90.9  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.27 
 
 		 513 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 478 aa  90.5  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.79 
 
 		 513 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.27 
 
 		 513 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.79 
 
 		 513 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 		 476 aa  90.1  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  24.57 
 
 		 537 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2939  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.17 
 
 		 478 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.17 
 
 		 478 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  24.63 
 
 		 537 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 516 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 500 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.16 
 
 		 535 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 489 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.19 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.08 
 
 		 525 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 478 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.19 
 
 		 469 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  23.66 
 
 		 476 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  25.19 
 
 		 478 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.96 
 
 		 505 aa  87  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>