More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0925 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 445 aa  853    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  60 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  47.17 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  45.58 
 
 		 495 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 		 489 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  36.97 
 
 		 462 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 515 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 461 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  42.83 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  29.91 
 
 		 468 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  39.6 
 
 		 471 aa  195  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  58.76 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  34.47 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 497 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.5 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.59 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.77 
 
 		 495 aa  110  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 490 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 500 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 496 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.29 
 
 		 513 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  24.78 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.24 
 
 		 511 aa  97.1  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 489 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.18 
 
 		 479 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 481 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 489 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.99 
 
 		 513 aa  96.3  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  23.99 
 
 		 513 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.99 
 
 		 513 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.75 
 
 		 513 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.29 
 
 		 513 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.29 
 
 		 513 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  25 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  27.44 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3297  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.75 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.65 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.57 
 
 		 506 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.67 
 
 		 528 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  24.76 
 
 		 478 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.11 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.94 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 450 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.32 
 
 		 513 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.32 
 
 		 513 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 478 aa  93.2  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 478 aa  93.2  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.67 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  24.7 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 502 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 548 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  32.91 
 
 		 515 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.49 
 
 		 562 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  29.79 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 458 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  27.83 
 
 		 1062 aa  87.8  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0727  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 476 aa  87  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.08 
 
 		 501 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.94 
 
 		 541 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  25.49 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 697 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.6 
 
 		 565 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.36 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 539 aa  83.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.25 
 
 		 511 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 		 682 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 		 682 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  22.66 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.18 
 
 		 526 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>