More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3297 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3297  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 477 aa  916    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  25.7 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 515 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  27.8 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 491 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1768  drug transporter, putative  21.93 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.480202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 569 aa  80.9  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2200  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0335297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2238  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000374432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  26.41 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.29 
 
 		 592 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  30.19 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0742  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368035  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  27.6 
 
 		 515 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  33.13 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 678 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  29.31 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.91 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.56 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  27.56 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.53 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  25.53 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.53 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.47 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.53 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.38 
 
 		 530 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 531 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.47 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  25.53 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03383  conserved hypothetical protein  25.27 
 
 		 579 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.34 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  23.73 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1525  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.22 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.39 
 
 		 522 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 467 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5086  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 529 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190759  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 467 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  26.52 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 650 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02985  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08530)  27.67 
 
 		 626 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.29 
 
 		 890 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.75 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  20.85 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33428  MDR transporter  25 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.153237  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03264  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03320)  28.29 
 
 		 571 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.591417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.18 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  21.09 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.19 
 
 		 680 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.18 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.56 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_003296  RS05301  integral membrane transmembrane protein  33.92 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.28 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.28 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.28 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  23.28 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.28 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.28 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.28 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.28 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.56 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>