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for query gene PICST_33428 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_33429  MDR transporter  69.42 
 
 		 627 aa  755    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921867  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33428  MDR transporter  100 
 
 		 609 aa  1225    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.153237  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32634  multidrug-resistance transporte  44.85 
 
 		 607 aa  489  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0035637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65867  multidrug-resistance transporte  45.27 
 
 		 566 aa  476  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30771  multidrug-resistance transporte  41.94 
 
 		 599 aa  464  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0875781  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52044  multidrug-resistance transporter  42.96 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.114118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60980  multidrug-resistance transporter  43.67 
 
 		 526 aa  395  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.573289  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02985  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08530)  30.56 
 
 		 626 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60552  Azole resistance protein 1  29.57 
 
 		 525 aa  236  8e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08095  MFS toxin efflux pump (AflT), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12620)  30.34 
 
 		 539 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00148493  normal  0.123632 
 
 
-
 
NC_006686  CND00440  aflatoxin efflux pump AFLT, putative  30.83 
 
 		 632 aa  232  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01310  transporter, putative  32.82 
 
 		 587 aa  228  4e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.206472  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08459  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16910)  32.21 
 
 		 540 aa  220  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0473828  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11217  MFS toxin efflux pump (AflT), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12620)  30.24 
 
 		 620 aa  216  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.410395  decreased coverage  0.00637079 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07200  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 		 541 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.649284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.01 
 
 		 680 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.21 
 
 		 685 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 		 528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07112  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03920)  27.06 
 
 		 579 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05370  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00940)  26.91 
 
 		 617 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03264  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03320)  26.41 
 
 		 571 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.591417 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03383  conserved hypothetical protein  28.54 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01481  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14490)  29.77 
 
 		 572 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.25 
 
 		 678 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03254  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.845796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 		 537 aa  186  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.82 
 
 		 569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 685 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  27.69 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 650 aa  183  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.65 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.29 
 
 		 676 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03290  tetracycline efflux protein, putative  29.77 
 
 		 652 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0454964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  27.44 
 
 		 537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  28.44 
 
 		 537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37347  suppressor of gal11 null  26.6 
 
 		 569 aa  181  4.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  27.98 
 
 		 537 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 539 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  27.98 
 
 		 537 aa  179  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  27.98 
 
 		 537 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
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NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 538 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.11 
 
 		 682 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.11 
 
 		 682 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.11 
 
 		 682 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.84 
 
 		 538 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  31.1 
 
 		 1062 aa  176  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 		 565 aa  176  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.83 
 
 		 565 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.36 
 
 		 697 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.76 
 
 		 530 aa  174  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 522 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.39 
 
 		 890 aa  173  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.13 
 
 		 561 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.76 
 
 		 539 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.43 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 		 504 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09291  MFS transporter/NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  26.35 
 
 		 1429 aa  170  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.612023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.69 
 
 		 541 aa  170  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 516 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.01 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.89 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 		 554 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2812  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.67 
 
 		 1102 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.220309 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 504 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 504 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.63 
 
 		 850 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.36 
 
 		 666 aa  168  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 519 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.66 
 
 		 504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31 
 
 		 501 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.52 
 
 		 525 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 504 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01031  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02720)  27.49 
 
 		 538 aa  166  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388613  normal  0.247774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  29.09 
 
 		 666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  31.88 
 
 		 515 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.75 
 
 		 621 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.96 
 
 		 510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  28.45 
 
 		 476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.66 
 
 		 509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.66 
 
 		 509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.13 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  30.85 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  30.85 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 		 514 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 558 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
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NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.85 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.13 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.13 
 
 		 513 aa  161  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
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