More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1216 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  100 
 
 		 462 aa  852    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 515 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 498 aa  223  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  36.92 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  31.25 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 483 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  35.73 
 
 		 495 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 445 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  36.83 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 461 aa  176  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  34.23 
 
 		 471 aa  176  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  37.12 
 
 		 492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 491 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.77 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 486 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 504 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 497 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 489 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 496 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.46 
 
 		 517 aa  113  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1453  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.19 
 
 		 495 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 487 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 490 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.53 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 478 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  30.24 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  31.16 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3297  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 481 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 479 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2444  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.96 
 
 		 515 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  29.36 
 
 		 501 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 467 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11650  drug efflux membrane protein  38.61 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.306969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 448 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 		 495 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.89 
 
 		 538 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 514 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.25 
 
 		 504 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  28.27 
 
 		 548 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 		 505 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  31.25 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  24.31 
 
 		 507 aa  94  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 458 aa  94  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 		 541 aa  93.6  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 498 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.16 
 
 		 537 aa  93.6  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0088  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 467 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1508  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 467 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.81 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.03 
 
 		 592 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 489 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 650 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.63 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  26.13 
 
 		 537 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  29.21 
 
 		 513 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  26.16 
 
 		 537 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.31 
 
 		 476 aa  90.5  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 702 aa  90.5  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.63 
 
 		 561 aa  90.5  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.47 
 
 		 535 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 471 aa  90.1  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 		 491 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.05 
 
 		 538 aa  90.1  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.45 
 
 		 491 aa  90.1  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 678 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 483 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2324  putative transport transmembrane protein  29.96 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.37 
 
 		 506 aa  89.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  26.05 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.58 
 
 		 523 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.27 
 
 		 537 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  22.58 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 		 480 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  25.36 
 
 		 537 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  25.36 
 
 		 537 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.8 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  25.36 
 
 		 537 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  26.27 
 
 		 537 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>