More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1058 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  100 
 
 		 471 aa  888    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0948  metal-tetracycline/H+ antiporter  31.53 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000160748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0970  major facilitator family transporter  30.89 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.192383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1037  major facilitator family transporter  30.89 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0958  major facilitator family metal-tetracycline/H(+) antiporter  31.28 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000104996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1115  major facilitator family transporter  30.67 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 		 540 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.29 
 
 		 564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 		 477 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.35 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.63 
 
 		 482 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  28.76 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 493 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.54 
 
 		 658 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 		 570 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  27.79 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.81 
 
 		 493 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 		 534 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 512 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  28.54 
 
 		 473 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.11 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.64 
 
 		 534 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  30.95 
 
 		 683 aa  157  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.64 
 
 		 458 aa  156  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.73 
 
 		 509 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.7 
 
 		 599 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.22 
 
 		 599 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.47 
 
 		 522 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.17 
 
 		 504 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.89 
 
 		 505 aa  153  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.53 
 
 		 456 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 643 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 643 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.75 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4624  major facilitator family transporter  30.33 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0497223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  29.66 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 599 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  24.75 
 
 		 599 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.75 
 
 		 599 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 599 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 558 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.16 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.4 
 
 		 500 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  24.75 
 
 		 599 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.5 
 
 		 597 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.75 
 
 		 599 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4590  major facilitator family transporter  30.08 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 		 490 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4380  major facilitator family transporter  30.08 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000603608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4221  tetracycline resistence protein, metal-tetracycline/H+ antiporter  30.08 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4718  major facilitator family transporter  30.08 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.97 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4574  major facilitator family transporter  30.08 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 		 497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  31.06 
 
 		 515 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.75 
 
 		 561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.33 
 
 		 478 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 457 aa  147  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 484 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.01 
 
 		 494 aa  147  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  27.57 
 
 		 465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.93 
 
 		 501 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.48 
 
 		 635 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.22 
 
 		 517 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 479 aa  146  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.57 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.84 
 
 		 657 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
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NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 546 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  27.02 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
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NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
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NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  26.67 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
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NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.29 
 
 		 500 aa  144  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 457 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 457 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 457 aa  143  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  27.02 
 
 		 457 aa  143  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 457 aa  143  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_01799  predicted transporter  26.79 
 
 		 457 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
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NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 		 537 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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