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for query gene Tcur_4396 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  62.98 
 
 
535 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2523  major facilitator superfamily MFS_1  67.05 
 
 
551 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
526 aa  1018    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.53 
 
 
555 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.2 
 
 
575 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4865  major facilitator superfamily MFS_1  61.11 
 
 
477 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.43 
 
 
534 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.97 
 
 
522 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  52.67 
 
 
571 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.79 
 
 
522 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19560  arabinose efflux permease family protein  55.49 
 
 
552 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301888  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.21 
 
 
566 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.54 
 
 
524 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.96 
 
 
737 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0854  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.24 
 
 
711 aa  498  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0773  major facilitator transporter  51.64 
 
 
518 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.15 
 
 
850 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2821  major facilitator superfamily MFS_1  54.11 
 
 
544 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.29 
 
 
531 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5709  major facilitator transporter  51.05 
 
 
578 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494905  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33640  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.89 
 
 
575 aa  435  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179116  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.29 
 
 
624 aa  405  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.45 
 
 
526 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.69 
 
 
554 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.7 
 
 
569 aa  343  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.18 
 
 
592 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 
584 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  42.8 
 
 
538 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.44 
 
 
535 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.92 
 
 
525 aa  330  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 
522 aa  329  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.77 
 
 
680 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.23 
 
 
535 aa  319  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.73 
 
 
523 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.19 
 
 
530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.42 
 
 
650 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.44 
 
 
685 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.6 
 
 
682 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.73 
 
 
682 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.73 
 
 
682 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.09 
 
 
672 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.18 
 
 
516 aa  302  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.72 
 
 
666 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.06 
 
 
528 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.43 
 
 
525 aa  299  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.76 
 
 
558 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  37.95 
 
 
666 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.6 
 
 
697 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 
607 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.48 
 
 
678 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.02 
 
 
1062 aa  290  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.55 
 
 
504 aa  286  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.23 
 
 
528 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 
641 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 
524 aa  280  6e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.37 
 
 
685 aa  279  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.21 
 
 
555 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.63 
 
 
592 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 
539 aa  277  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 
505 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.24 
 
 
593 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 
504 aa  273  8.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 
514 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 
676 aa  269  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.46 
 
 
562 aa  269  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.28 
 
 
504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.29 
 
 
513 aa  266  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.49 
 
 
565 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.06 
 
 
509 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 
538 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 
538 aa  263  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.36 
 
 
557 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.84 
 
 
501 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
523 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.65 
 
 
520 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23860  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.5 
 
 
572 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0809765  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.17 
 
 
528 aa  260  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.54 
 
 
509 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.54 
 
 
509 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.67 
 
 
509 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.31 
 
 
504 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.12 
 
 
541 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.11 
 
 
567 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 
538 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 
504 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.56 
 
 
504 aa  256  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.56 
 
 
504 aa  256  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.56 
 
 
504 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 
539 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.31 
 
 
504 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.31 
 
 
519 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.31 
 
 
504 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.31 
 
 
504 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 
575 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  36.53 
 
 
501 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
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NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 
615 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
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NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.67 
 
 
485 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
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NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.76 
 
 
519 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  35.8 
 
 
537 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
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