More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1189 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 400 aa  761    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  54.39 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  48.48 
 
 		 407 aa  336  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 394 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 400 aa  276  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  40.52 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.41 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.16 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  25.34 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  27.14 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0644  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.592278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  23.83 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.98 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.05 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  28.32 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  31.94 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.1 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  26.91 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.37 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.37 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2247  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.58 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.84 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.06 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.210612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>