More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1794 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  100 
 
 
389 aa  769    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
417 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  37.63 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  35.81 
 
 
391 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  34.27 
 
 
404 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
396 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 
420 aa  196  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 
404 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 
402 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2804  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 
403 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0158758  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
421 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2336  major facilitator transporter  35.54 
 
 
368 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
371 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
388 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  33.07 
 
 
390 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  30.34 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 
401 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 
398 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  30.13 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  26.91 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  27.48 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  26.12 
 
 
403 aa  126  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  25.92 
 
 
410 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  25.86 
 
 
403 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
395 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  26.6 
 
 
415 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  25.27 
 
 
422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  25.86 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
408 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
408 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  25.73 
 
 
412 aa  119  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  25.65 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  27.15 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  28.46 
 
 
410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  27.2 
 
 
403 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  25.61 
 
 
396 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  27.49 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  26.22 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  27.04 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  27.32 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  26.53 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  26.12 
 
 
409 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  25.58 
 
 
423 aa  109  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
410 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  26.09 
 
 
403 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  25.83 
 
 
403 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  25.83 
 
 
403 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  25.83 
 
 
403 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
410 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  25.83 
 
 
403 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  26.09 
 
 
403 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
410 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  28.52 
 
 
404 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  25.83 
 
 
403 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  26.84 
 
 
403 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  25.83 
 
 
403 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
389 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  24.6 
 
 
391 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
399 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
393 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  22.37 
 
 
420 aa  106  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  22.37 
 
 
416 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
380 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  22.37 
 
 
417 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  22.37 
 
 
416 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  22.37 
 
 
417 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  22.37 
 
 
417 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  22.37 
 
 
416 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  22.37 
 
 
416 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  25 
 
 
393 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  25.64 
 
 
403 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  24.8 
 
 
401 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1552  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
413 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00281859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  26.33 
 
 
404 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  24.17 
 
 
422 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  25.54 
 
 
421 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  26.33 
 
 
404 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  23.41 
 
 
411 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  26.52 
 
 
404 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  26.17 
 
 
403 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  27.25 
 
 
402 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 
406 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
421 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  25.94 
 
 
406 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  24.18 
 
 
415 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 
406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 
406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  26.38 
 
 
402 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 
406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  26.74 
 
 
406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  25.94 
 
 
406 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  25.94 
 
 
406 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  24.66 
 
 
420 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 
419 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 
408 aa  99.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  24.93 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>