More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3717 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
394 aa  756    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  80.84 
 
 
434 aa  606  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  51.04 
 
 
407 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  53.17 
 
 
400 aa  361  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  51.62 
 
 
398 aa  316  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
390 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 
394 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
390 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
406 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  28.18 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
461 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
219 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  28.37 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  28.37 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.59 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  27.41 
 
 
421 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 
407 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  23.62 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.26 
 
 
448 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.68 
 
 
434 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  25.83 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.49 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  24.48 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.58 
 
 
430 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  25.09 
 
 
422 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  25.09 
 
 
427 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  25.57 
 
 
405 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
460 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.75 
 
 
460 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  24.82 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  23.67 
 
 
434 aa  57  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  24.82 
 
 
420 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  25.18 
 
 
420 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.23 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.23 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  25.99 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.27 
 
 
439 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  25.09 
 
 
685 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  27.51 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  27.51 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  25.85 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  27.23 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  23.05 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
439 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.42 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  27.51 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  25.91 
 
 
443 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  34.46 
 
 
484 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
395 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  23.38 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.21 
 
 
443 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  23.65 
 
 
445 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  23.6 
 
 
450 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  26.58 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  24.35 
 
 
430 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 
432 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  26.87 
 
 
403 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1347  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.258837  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.69 
 
 
407 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  24.09 
 
 
420 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
421 aa  53.5  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 
534 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  28.57 
 
 
440 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  20.66 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  23.39 
 
 
383 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  24.68 
 
 
391 aa  53.1  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  29.28 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  26.41 
 
 
458 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.37 
 
 
456 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.33 
 
 
437 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  25.99 
 
 
418 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  23.36 
 
 
450 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  26.21 
 
 
435 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>