More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1135 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  785    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  56.74 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  43.01 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 429 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 408 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 414 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  29.68 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  25.27 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  25 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  25 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  25 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.54 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.62 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.27 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  24.37 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 410 aa  87.8  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.3 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.89 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.39 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  21.95 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.62 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  21.95 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.89 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  22.58 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  22.89 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  22.53 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  22.89 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  28.11 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  30.09 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  26.18 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  24.69 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  23.71 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 422 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.53 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  25.73 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  22.71 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  25.26 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  26.02 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>