More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0284 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  771    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  56.74 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  37.9 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 409 aa  235  8e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 429 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.94 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.79 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.97 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.37 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  25 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  22.76 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  21.98 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.83 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.04 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  21.98 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.72 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  23.8 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.38 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.38 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.29 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  21.88 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.38 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  21.88 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22.55 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  21.88 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  22.87 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  22.87 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  22.76 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.5 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  21.45 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  20.18 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 553 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  21.87 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  23.06 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  21.28 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  24.21 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  19.88 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  21.16 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.85 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  21.76 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  20.93 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  21.84 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  21.28 
 
 		 505 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  21.28 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  23.95 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  19.83 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1131  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.209154  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>