More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2181 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  100 
 
 		 402 aa  786    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  72.51 
 
 		 392 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  35.58 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  35.32 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  35.32 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  35.06 
 
 		 399 aa  236  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  34.81 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  34.81 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  34.81 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  34.81 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  34.81 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  30.43 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  29.93 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  29.53 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 447 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  29.53 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  29.53 
 
 		 506 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  29.54 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  27.96 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  29.54 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  29.54 
 
 		 396 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  29.54 
 
 		 396 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  29.53 
 
 		 506 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  28.39 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  27.79 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 396 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 421 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  29.66 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  27.42 
 
 		 381 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  28.65 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  27.42 
 
 		 381 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  28.28 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  27.42 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  27.15 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  27.15 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  27.84 
 
 		 381 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  26.87 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  27.53 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  25.64 
 
 		 390 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 404 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  27.07 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.02 
 
 		 409 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  24.08 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 419 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.88 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  25.59 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0293  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.48 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  25 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1601  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0564128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  23.99 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28210  arabinose efflux permease family protein  25.99 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.17 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0792  major facilitator superfamily transporter  25.98 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.376906 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.68 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.68 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6796  hypothetical protein  26.59 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4141  major facilitator superfamily transporter  25.07 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00457527  normal  0.517797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  22.97 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3887  major facilitator superfamily transporter  25.28 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0088  major facilitator superfamily transporter  25.73 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>