More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0094 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  845    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  65.55 
 
 		 408 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  61.31 
 
 		 414 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  41.26 
 
 		 394 aa  247  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 409 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  33.07 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.54 
 
 		 409 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 406 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  25.27 
 
 		 381 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.54 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.87 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 392 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 381 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  27.85 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.47 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  28.53 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  26.79 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  27.04 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  26.46 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  26.82 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  26.02 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.27 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 505 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.37 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  22.76 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.35 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  31.94 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  24.82 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.98 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.03 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.03 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  22.32 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.09 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.03 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  22.32 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  21.75 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  21.75 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  21.75 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  20.9 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  35.11 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  34.84 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  21.47 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  28.4 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  25.47 
 
 		 530 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  20.9 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4495  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  24.22 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>