More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3242 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  763    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  55.67 
 
 		 403 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  51.94 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  52.53 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  52.44 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  52.44 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  52.44 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  50.38 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  47.56 
 
 		 405 aa  309  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  48.37 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  50.68 
 
 		 422 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 403 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 		 409 aa  89.4  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  30.03 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.21 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  24.19 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  28.62 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  24.16 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.59 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.28 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.35 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.14 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  27.54 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.4 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  28.13 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  27.1 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  25 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  24.15 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  24.15 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  24.15 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.39 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  28.96 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  22.14 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.66 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  24.15 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  25.39 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.01 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.9 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.82 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.06 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>