More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1482 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
403 aa  771    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  51.94 
 
 
440 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  52.2 
 
 
421 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  55.67 
 
 
401 aa  360  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  52.19 
 
 
405 aa  351  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 
435 aa  348  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  53.91 
 
 
420 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  51.16 
 
 
423 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  51.16 
 
 
423 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  51.16 
 
 
423 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  51.41 
 
 
400 aa  324  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  47.41 
 
 
434 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  55.11 
 
 
422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  39.6 
 
 
431 aa  213  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 
403 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.98 
 
 
387 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
404 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.9 
 
 
394 aa  86.3  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  27.22 
 
 
412 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  27.95 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.47 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  30.06 
 
 
414 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.37 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.98 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  25.61 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  39.47 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.38 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.57 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  25.07 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  26.83 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.69 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  25.75 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  25.67 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.2 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
505 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.61 
 
 
416 aa  77  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  25.76 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.57 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  25.75 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.41 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.48 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25.48 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.48 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  25.48 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  32.19 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  30.54 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.25 
 
 
506 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  26.1 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.47 
 
 
506 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  31.38 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.75 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  31.38 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  26.09 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  31.37 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  24.65 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 
504 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 
615 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.46 
 
 
558 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  25.47 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.87 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  26.25 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  25.77 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  25.85 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.77 
 
 
525 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.35 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  25.61 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 
530 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 
578 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  25.61 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  25.07 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  25.07 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.86 
 
 
540 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  25.85 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.04 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  25.85 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.51 
 
 
516 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  31.76 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  34.16 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.03 
 
 
528 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  30.43 
 
 
501 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>