More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2207 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
396 aa  792    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 
408 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  57.4 
 
 
419 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  56.71 
 
 
395 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  55.84 
 
 
395 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
396 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  30.75 
 
 
381 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  30.45 
 
 
381 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  30.75 
 
 
381 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  30.45 
 
 
381 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  30.45 
 
 
381 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  31.04 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  30.15 
 
 
381 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
391 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  28.99 
 
 
381 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  29.85 
 
 
381 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  28.8 
 
 
399 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  32.11 
 
 
399 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  28.77 
 
 
400 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  27.16 
 
 
400 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  27.16 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  26.9 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  27.18 
 
 
506 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  26.65 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  26.79 
 
 
506 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  26.65 
 
 
400 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  26.84 
 
 
447 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  30.42 
 
 
399 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  31.18 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  29.86 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  30.9 
 
 
399 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  30.34 
 
 
399 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  26.53 
 
 
505 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  26.4 
 
 
399 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  30.06 
 
 
399 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  30.06 
 
 
399 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  30.06 
 
 
399 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  30.06 
 
 
399 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  29.3 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
415 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.46 
 
 
409 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  27.5 
 
 
390 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  27.85 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
410 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  25.42 
 
 
402 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  28.21 
 
 
403 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  28.21 
 
 
403 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  26.69 
 
 
412 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.17 
 
 
370 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  25.35 
 
 
392 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  27.58 
 
 
370 aa  100  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  26.84 
 
 
392 aa  99.4  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  25.56 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  27.48 
 
 
401 aa  95.5  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  22.94 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  22.94 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.93 
 
 
387 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  28.62 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  23.92 
 
 
391 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  23.88 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  24.78 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  25.38 
 
 
411 aa  90.1  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
387 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  21.02 
 
 
402 aa  89.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
421 aa  87  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  25.89 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  24.94 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  22.97 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  22.97 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  22.97 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  22.01 
 
 
396 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  22.96 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  25.56 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.63 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22.66 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  22.96 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  22.66 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.36 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.05 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.05 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.05 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  26.97 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.05 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.05 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.59 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  27.65 
 
 
411 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  22.5 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  25.66 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  31.82 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.43 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>