More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2764 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
389 aa  761    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  66.41 
 
 
387 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 
392 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  45.43 
 
 
370 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  37.1 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  38.52 
 
 
398 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
427 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  36.72 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 
398 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  39.62 
 
 
386 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 
398 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  36.1 
 
 
426 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  35.92 
 
 
416 aa  212  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  36.5 
 
 
428 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
424 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 
425 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  34.56 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 
439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 
423 aa  197  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  33.25 
 
 
416 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
421 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  34.32 
 
 
400 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  35.42 
 
 
419 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  33.78 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  33.78 
 
 
400 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  32.49 
 
 
424 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 
390 aa  185  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.9 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.9 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  33.89 
 
 
421 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
414 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
428 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  31.96 
 
 
387 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  32.11 
 
 
417 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  34.05 
 
 
400 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  34.63 
 
 
414 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
408 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.63 
 
 
414 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  33.78 
 
 
400 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  29.24 
 
 
387 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  29.29 
 
 
398 aa  177  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  33.79 
 
 
422 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  35.5 
 
 
419 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  33.24 
 
 
407 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  33.24 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  33.51 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  33.24 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  33.51 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  33.51 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  33.51 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  33.33 
 
 
421 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  32.76 
 
 
424 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 
434 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  33.52 
 
 
405 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  34.07 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  34.44 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 
394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
401 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  33.01 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
396 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  32.51 
 
 
428 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
411 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 
408 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
406 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  36.34 
 
 
415 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  35.99 
 
 
397 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  34.56 
 
 
405 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  33.52 
 
 
399 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 
426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  30.32 
 
 
411 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  33.6 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  31.93 
 
 
417 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1298  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 
402 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.148337  normal  0.167522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 
407 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  36.28 
 
 
397 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  35.99 
 
 
399 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
430 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  36.28 
 
 
397 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  33.61 
 
 
406 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.61 
 
 
406 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  33.99 
 
 
419 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  35.99 
 
 
399 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  35.99 
 
 
399 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  29.54 
 
 
411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  29.22 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
453 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  29.2 
 
 
411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  30.41 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  32.87 
 
 
434 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  31.18 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
397 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  30.31 
 
 
401 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  31.83 
 
 
405 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  31.3 
 
 
406 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  28.68 
 
 
449 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  33.24 
 
 
411 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  33.53 
 
 
396 aa  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  32.01 
 
 
397 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>