More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0353 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  79.84 
 
 		 388 aa  646    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  100 
 
 		 387 aa  758    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  79.84 
 
 		 388 aa  646    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 390 aa  309  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  41.71 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  42.01 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  39.02 
 
 		 387 aa  255  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  41.97 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  41.97 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  41.45 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  41.45 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  41.71 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  41.71 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  41.45 
 
 		 400 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 398 aa  226  8e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 392 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.08 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 421 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 402 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 397 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.56 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  26.27 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  23.56 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.35 
 
 		 409 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  25.07 
 
 		 424 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  25.07 
 
 		 424 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.6 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  25.07 
 
 		 399 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  26.68 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.17 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 386 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 399 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  25 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  25.56 
 
 		 396 aa  95.9  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  23.71 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  27.17 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  23.31 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.79 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  25 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 398 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 408 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  22.53 
 
 		 411 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 406 aa  90.1  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  25.73 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  26.18 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 434 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 453 aa  87.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  25.98 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  30.51 
 
 		 422 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 415 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>